Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc144bE9PVZ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms