Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms