Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms