Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl3E0CZ16 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms