Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20521D3Z5F7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20521D3Z5F7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms