Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptrhd1D3Z4S3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms