Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms