Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms