Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms