Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30cD3YVI9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30cD3YVI9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms