Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc13D3YV10 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms