Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Catsperg2C6KI89 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms