Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnldc1B2RXZ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms