Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah3B2RWG3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah3B2RWG3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms