Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rd3lB2RV38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms