Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms