Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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