Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zscan5bB2RTN3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms