Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms