Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms