Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf518bB2RRE4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms