Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf1B2RRD7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms