Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed5B2RPU8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms