Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms