Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CK137956B1AYM9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms