Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms