Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slfn8B1ARD8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms