Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprsB0V2N1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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