Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-M5A7VMS3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms