Protein–RNA interactions for Protein: A3KGK3

Fer1l4, Fer-1-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l4A3KGK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fer1l4A3KGK3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms