Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms