Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samt1A2BED8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samt1A2BED8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms