Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SktA2AQ25 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SktA2AQ25 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms