Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms