Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc183A2AJB1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms