Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms