Protein–RNA interactions for Protein: A2A9F4

Kdf1, Keratinocyte differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdf1A2A9F4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdf1A2A9F4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdf1A2A9F4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms