Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prdm2A2A7B5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms