Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc27A2A6Q5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms