Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calcoco2A2A6M5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms