Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc173A0JLY1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms