Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms