Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms