Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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