Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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