Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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LMAN2Q12907 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LMAN2Q12907 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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