Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RUNX3Q13761 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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