Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms