Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csmd2V9GX34 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csmd2V9GX34 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms