Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms